Aa! Megamisama nos muestra la historia romántica entre Belldandy, una diosa de primera clase, con Keiichi Morisato, un estudiante marcado por el infortunio. Para equilibrar su suerte y recompensarlo por su buen corazón, a Keiichi se le concede un deseo cuando marca sin querer el número del cielo. Belldandy es la encargada de concedérselo personalmente, sin embargo, Keiichi cree que la aparición de la hermosa joven que dice ser una diosa es parte de una broma que le están gastando sus amigos y tratando de seguirle el juego desea que “una diosa como tú permanezca conmigo para siempre“. Cuando se hace evidente que Belldandy es una diosa ya no puede retractarse de su deseo. La historia continúa narrándonos como deben afrontar ambos su vida en común así como las fuerzas y personajes que intentarán separarlos o poner a prueba sus sentimientos.